Oltre a sostenere ricerche indipendenti di singoli giovani studiosi, la FEF promuove alcuni grandi progetti di ricerca collettiva, al fine di costituire repertori di testi e manoscritti, bibliografie speciali, edizioni critiche di testi inediti. Molti di questi progetti pubblicano i loro risultati on line in forma di database (www.mirabileweb.it), all'interno di un sistema che promuove l'interoperabilità a livello europeo (http://trame.fefonlus.it).